Эта церковь несколько раз строилась заново или реставрировалась. Первое (деревянное) здание Благовещенской церкви было возведено у 7-й линии Васильевского острова, а его проект создал Дж. Трезини. Произошло это событие в 1740-1742 годах. Церковь, стоявшая на берегу большого пруда, была построена на деньги Р.И. Чиркина, владельца заводов, производящих пиво.

24 мая 1750 года было заложено здание церкви из камня, основной алтарь которого осветил (сентябрь 1762 год) епископ Кексгольский и Ладожский Тихон Задорский, а деревянную церковь разобрали. В этой церкви имеется 7 (больше всех в городе) престолов — Благовещенский, Зачатьевский, Никольский, Крестовоздвиженский, Ильинский, Покровский, Сретенский. А к 1780 году была сооружена 52-метровая колокольня, имеющая три яруса, и ставшая самой высокой на Васильевском острове.

В 1926-1928 годах решено было рядом с нею разбить сад. Однако в 1936 году церковь закрыли, а в её здании разместили проектно-монтажное бюро. Спустя три года около храма построили здание управления завода. Во время блокады Ленинграда в здание храма попало очень много артиллерийских снарядов, поэтому оно достаточно сильно пострадало. Так как артобстрелы были частыми, руководство города решило разобрать купола, но смогли разобрать лишь центральный купол. После окончания войны была проведена реставрация здания храма, а в 1952 году полностью был восстановлен и центральный купол. В часовне работала вначале торговая точка, а потом кафе.

До 1958 года здание считалось архитектурным памятником, но после — перестало считаться таковым. Поэтому те, кто арендовал здесь помещения, перестраивали их. Тут разместились теплоцентр, душевые, туалеты, электрощитовая и водораспредузел. Вся территория храма разделили на отдельные кабинеты.

Здание храма вернули церкви только в 1992 году, а часовню — в 1995-м. Сейчас ведутся работы по реставрации церкви, которая открыта для прихожан с 9.00 до 18.00 (ежедневно).